Naast zijn praktijk was Yan als senior onderzoeker verbonden aan het Sino-Dutch Centre for Preventive and Personalized Medicine, een onderzoeksgroep van TNO, en als wetenschappelijk directeur aan de Boann Systemic Research Group. Hij publiceerde regelmatig in vaktijdschriften en geeft lezingen, cursussen en workshops op het gebied van systeemtheorie, systeembiologie en klassieke Chinese geneeskunde.

In zijn onderwijs verweeft hij systeembiologie, kwantumtheorie, daoïsme en Chinese geneeskunde tot één samenhangend geheel, waarin oosterse en westerse manieren van kijken elkaar verhelderen. Als gastdocent is hij verbonden aan diverse nationale en internationale opleidingen, en als spreker treedt hij op tijdens congressen over de hele wereld.